Orgánmi VEGA sú:
a) predsedníctvo
b) predseda a podpredseda
c) rozšírené predsedníctvo
d) komisie
Výkonnými orgánmi VEGA pre jednotlivé odbory vedy a techniky sú komisie VEGA (s paritným zastúpením členov z rezortu školstva a SAV). Zriaďuje ich minister školstva, výskumu, vývoja a mládeže SR a predseda Slovenskej akadémie vied spoločne na základe návrhov vedeckých rád príslušných organizácií.
Predsedovia a podpredsedovia komisií VEGA tvoria rozšírené predsedníctvo VEGA, ktoré si na svojom prvom zasadnutí zvolilo zo svojich radov predsedu a podpredsedu VEGA a ostatných 4 členov predsedníctva VEGA (spolu je šesťčlenné). V zmysle štatútu VEGA sa predseda a podpredseda VEGA, ako aj predsedovia a podpredsedovia jednotlivých komisií striedajú vo funkcii v polovici ich funkčného obdobia.
8. funkčné obdobie
- Zloženie orgánov VEGA – 2. polovica 8. funkčného obdobia (2021-2025) aktualizované k 30.6.2025
- Zloženie komisií VEGA v 8. funkčnom období (2021-2025) aktualizované k 30.6.2025